第1章 零基础快速入门 1
1.1 ITK-SNAP 1
1.2 三维医学图像的种类 9
1.3 DICOM 15
1.4 从头开发三维医学图像处理与分析软件 19
第2章 三维医学图像的分割 40
2.1 分割简介 40
2.2 传统阈值法 43
2.3 Otsu阈值法 45
2.4 基于区域的分割方法 46
2.5 活动轮廓法 50
2.6 水平集方法 55
2.7 三维CT图像中肝区与肝段的分割 60
第3章 三维医学图像的配准 75
3.1 elastix 75
3.2 图像配准的基础理论 81
3.3 transformix 91
3.4 使用vv和elastix的配准实战 93
3.5 基于elastix开发自己的配准软件 97
第4章 基于深度学习的三维医学图像分析 104
4.1 Python 104
4.2 Jupyter笔记本 105
4.3 OpenCV 107
4.4 读入DICOM图像 108
4.5 深度学习入门实战案例:区分胸部和腹部X光片 111
参考文献 116