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第1章 绪论 1

1.1 早期药物开发的过程 1

1.1.1 偶然发现 2

1.1.2 主动寻找 4

1.1.3 制药巨头 7

1.2 现今药物研发新技术和趋势 9

1.3 思政课程：长盛不衰的阿司匹林 13

思考题 15

第2章 先导化合物的发现 16

2.1 天然产物来源 17

2.2 化合物库 18

2.3 组合化学和高通量筛选 22

2.4 基于片段的药物发现 25

2.5 思政课程：中药所提供的发展优势 26

思考题 27

第3章 基于靶标结构的设计 28

3.1 靶标的确认 28

3.1.1 基因水平的药物靶标发现和验证 29

3.1.2 转录水平的药物靶标发现和验证 29

3.1.3 蛋白水平的药物靶标发现与验证 30

3.2 药效团模型构建 32

3.2.1 基于配体的药效团模型构建 32

3.2.2 基于受体的药效团模型构建 33

3.3 虚拟筛选 35

3.3.1 分子对接理论 36

3.3.2 分子对接方法分类 36

3.3.3 分子对接软件 38

思考题 40

第4章 基于配体的设计 41

4.1 经典的生物电子等排体 41

4.1.1 一价生物电子等排体 42

4.1.2 二价生物电子等排体 45

4.1.3 三价生物电子等排体 46

4.1.4 四价生物电子等排体 47

4.1.5 环等价生物电子等排体 48

4.2 非经典的生物电子等排体 50

4.2.1 羰基 50

4.2.2 羧基 51

4.2.3 羟基 55

4.2.4 儿茶酚 56

4.2.5 卤素 56

4.2.6 酰胺和酯 57

4.2.7 脲 61

4.2.8 吡啶 63

4.2.9 苯环 64

4.2.10 其他 65

思考题 68

第5章 结构优化提高活性 69

5.1 药效团修饰 69

5.1.1 分子作用力 69

5.1.2 跨膜能力与lg P和pKa 72

5.1.3 取代基的电性σ和疏水性π 75

5.1.4 化合物的几何构型和立体构型对活性的影响 75

5.2 骨架跃迁 77

5.2.1 优势骨架的结构 77

5.2.2 骨架跃迁的方法 78

5.3 药物修饰的原则 82

5.4 思政课程：药物结构优化思想的提出 83

思考题 84

第6章 类药性及其预测 85

6.1 类药性 85

6.2 类药性预测 90

思考题 94

第7章 结构改造优化类药性 95

7.1 药物的理化性质 95

7.2 基于类药性结构优化 97

7.2.1 药物在体内面对的屏障问题 97

7.2.2 结构改造提高水溶性 98

7.2.3 结构改造提高代谢稳定性 101

思考题 106

第8章 构效关系优化案例——大环内酯类药物 107

8.1 大环内酯类药物研究背景 107

8.2 第三代大环内酯类药物结构优化 110

思考题 117

第9章 构效关系优化案例——他汀类药物 118

9.1 他汀类药物研究背景 118

9.2 他汀类药物结构优化 119

思考题 123

第10章 构性关系优化案例——紫杉醇类药物 124

10.1 紫杉醇类药物研究背景 124

10.2 紫杉醇类药物结构优化 126

思考题 130

第11章 构性关系优化案例——青蒿素类药物 131

11.1 青蒿素类药物研究背景 131

11.2 青蒿素类药物结构优化 134

11.3 思政课程：为祖国科研人员自豪 137

思考题 138

第12章 药物专利 139

12.1 专利法律和相关公约的历史 139

12.2 专利资格 140

12.3 专利保护的要求 141

12.3.1 新颖性 141

12.3.2 创造性 142

12.3.3 实用性 142

12.4 专利的限制性 143

12.5 专利布局 143

12.6 专利申请的流程 144

12.7 药物专利中的马库什结构 146

12.8 专利侵权 147

12.9 思政课程：尊重知识产权 148

思考题 149

参考文献 150

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